Samurai Sudoku combina cinque griglie 9×9 sovrapposte. Le regole standard del Sudoku si applicano a ogni griglia: riempi ogni cella vuota con le cifre da 1 a 9 in modo che ogni riga, ogni colonna e ogni blocco 3×3 contenga tutte le cifre esattamente una volta. Le regioni sovrapposte appartengono a due griglie simultaneamente.