Samurai Sudoku combine cinq grilles 9×9 superposées. Les règles standard du Sudoku s'appliquent à chaque grille : remplissez chaque cellule vide avec les chiffres 1 à 9 afin que chaque ligne, chaque colonne et chaque bloc 3×3 contienne tous les chiffres exactement une fois. Les zones de chevauchement appartiennent à deux grilles simultanément.